RESONANCIA MAGNÉTICA DE INVESTIGACIÓN

Resonancia magnética de investigación

Responsable: Dra. Marina Benito

E-mail: mbenitov@sescam.jccm.es

La Imagen por Resonancia Magnética es una técnica  no invasiva  que permite obtener imágenes utilizando como contraste intrínseco la excitación de los protones (1H) de una  muestra dentro de  un campo magnético estático. Presenta una serie de ventajas sobre otras: (1) La principal, es que no utiliza radiaciones ionizantes, de ahí que sea una técnica no invasiva; (2) Se pueden adquirir cortes o planos en cualquier dirección; (3) Se obtienen imágenes de muy buena resolución. Sin embargo, uno de los principales inconvenientes es que se requieren largos tiempos de adquisición.

El laboratorio de Resonancia Magnética de Investigación del Hospital Nacional de Parapléjicos está destinado a realizar estudios tanto en rata como en ratón principalmente, aunque también podrían realizarse estudios en gatos pequeños y/o conejos.

El disponer de la criosonda para cerebro de ratón, le confiere a este laboratorio una ventaja bastante importante con respecto a otros equipos a nivel nacional ya que no hay muchas instalaciones con similares características.

El laboratorio ofrece servicio a los diferentes grupos de investigación del hospital así como a grupos externos y empresas privadas.

 

Equipamiento

• Bruker Biospec 70/30 con tres sistemas de gradientes : BGA 6S (1000mT/m), BGA 12S HP (440mT/m) y BGA 20S HP (200mT/m)
• Criosonda para imagen de cerebro de ratón
• Antenas de volumen para imagen de ratón, rata, gatos pequeños o conejos
• Antena para imagen de cerebro de rata
• Antena para imagen cardiaca y médula
• Antena de superficie 1H/31P para espectroscopía
• Dos estaciones de trabajo Linux: para adquisición ypara procesamiento con Paravision 6.0.1
• Sistema de monitorización cardiaca y respiratoria
• Sistema de calentamiento por agua caliente
• Sistema de anestesia inhalada
• Además, cuenta con una sala de estabulación de animales anexa al laboratorio

Servicios ofertados

• Imagen anatómica y morfológica
• Imagen de difusión y tractografía
• Relaxometría.
• Angiografía de Resonancia Magnética
• Espectroscopía localizada de 1H
• Espectroscopía heteronuclear de 31P
• Imagen cardiaca
• Imagen de muestras biológicas
• Administración de agentes de contraste para visualización y caracterizaciónpor imagen de Resonancia Magnética
• Procesamiento de las imágenes y espectros

PROTEÓMICA

Responsable de la Unidad: Gemma Barroso García

E-mail: gbarroso@sescam.jccm.es

 

La Unidad de Proteómica tiene por misión el poner a disposición de los investigadores las técnicas basadas en el análisis de proteínas, centrándose en la búsqueda de diseños experimentales adecuados e implantación de nuevas tecnologías en el ámbito de la Proteómica.

La unidad dispone de la instrumentación necesaria para la realización de experimentos de separación, cuantificación, identificación y caracterización de proteínas, así como para el estudio de sistemas de interés biológico y biomédico mediante técnicas de electroforesis y espectrometría de masas. Las técnicas proteómicas son válidas para la realización de estudios en investigación clínica.

Asimismo la unidad participa desde el año 2008 en el programa de formación continuada del Hospital Nacional de Parapléjicos-SESCAM, impartiendo cursos de Introducción a la Proteómica Básica.

 

Equipamiento

Espectrometría de masas

• 4800 Plus MALDI TOF/TOF (ABSciex).
• Nano-LC (Dionex Ultimate 3000) con micro-colector de fracciones Probot (Dionex).
• 4000 QTrap: (ABSciex).
• Nano-LC (Eksigent 2D Plus) acoplado al espectrómetro 4000 QTrap

Software para análisis de datos

• GPS Explorer™ , ProteinPilot™ (ABSciex). Programas de búsqueda automatizada de proteínas que incluyen el motor de búsqueda MASCOT V2.5
• MRMPilot (ABSciex) y Skyline para proteómica cuantitativa.

Electroforesis y Análisis de imagen 2D-gel

• Sistemas de isoelectroenfoque:

• Ettan IPGphor 3 (GE Healthcare)
• PROTEAN IEF Cell (BioRad)

• Sistemas de electroforésis:

• Ettan Dalt Six (GE Healthcare)
• Hoefer SE 600 (GE Healthcare)
• Mini-PROTEAN 3 Dodeca Cell y Mini-PROTEAN Tetra Cell (BioRad)

• ImageScanner III:
• Typhoon™ TRIO: Escáner para la visualización de imágenes fluorescentes, especialmente diseñado para geles DIGE (GE Healthcare).
• DeCyder™ Software específico para el análisis de expresión diferencial de geles de proteínas marcadas con tecnología DIGE (GE Healthcare).

Preparación de muestras en gel para identificación mediante espectrometría de masas:

• EXQuest Spot Cutter: (BioRad)
• Ettan Digester: (GE Healthcare)

 

Funcionamiento, servicios y tarifas

Funcionamiento

 

Tarifas

Separación de proteínas: Petición de Ensayo

     - Electroforesis en geles de poliacrilamida (SDS-PAGE)

     - Electroforesis 2D (2-DE)

     - Electroforesis 2D diferencial cuantitativa (2D-DIGE)

Análisis por espectrometría de masas: Petición de Ensayo

     - Determinación de masa molecular.

     - Estudios de fragmentación por ión.

     - Identificación de proteínas por MALDI.

     - Identificación de proteínas por LC-MS/MS.

     - Análisis Cuantitativo:

            SRM/MRM (Selected Reaction Monitoring/Multiple Reaction Monitoring)

Publicaciones y comunicaciones recientes

Pita-Thomas W, Barroso-García G, Moral V, Hackett AR, Cavalli V, Nieto-Diaz M. Identification of axon growth promoters in the secretome of the deer antler velvet Neuroscience. 2016 Nov 4. pii: S0306-4522(16)30604-2 Citada en PubMed; PMID: 27818162

Sánchez-Sierra M, García-Álvarez I, Fernández-Mayoralas A, Moreno-Lillo S, Barroso García G, Moral Dardé V, Doncel-Pérez E. Mass Spectrometry in Pharmacokinetic Studies of a Synthetic Compound for Spinal Cord Injury Treatment. Biomed Res Int. 2015;2015:169234 Citada en PubMed; PMID: 26090386

SPINAL CORD INJURY INDUCES LONG-TERM CHANGES IN THE RAT SPLEEN PROTEOME Angel Arevalo-Martin, Daniel Garcia-Ovejero, Veronica M Darde, Gemma Barroso, Yolanda Sierra-Palomares, Eduardo Molina-Holgado. 3rd International Spinal Cord Repair Meeting,  6-7 noviembre 2015 Barcelona.

Multiple Reaction Monitoring analysis reveals changes in S1P-S1Preceptor axis following spinal cord injury. Ángela del Águila, Verónica M. Darde, Gemma Barroso-García, Ana Gallardo-Escobar, David Reigada, Teresa Muñoz- Galdeano, Rosa Navarro-Ruiz, Marcos Caballero López, Rodrigo M. Maza, Manuel Nieto-Díaz.. 13th Human Proteome Organization World Congress October 5-8, 2014 Madrid, España

Personal

Barroso García, Gemma. Responsable de la Unidad.

e-mail: gbarroso@sescam.jccm.es

Gallardo Escobar, Ana. Preparación de muestras.

e-mail: agallardoe@sescam.jccm.es

González Arandilla, Alba. Especialista Espectrometría de masas.

e-mail: agarandilla@sescam.jccm.es

Contacto

Unidad de Proteómica

Edf. Investigación i-1Lab 21

Hospital Nacional de Parapléjicos

Finca La Peraleda s/n

45071 Toledo

España

E-mail: unidadproteomica.hnp@sescam.jccm.es

Tfno: (+34) 925 396 823

Tfno 2: (+34) 638 228 821

Fax: (+34) 925 396 821

¿QUIENES SOMOS?

Bienvenidos a nuestro blog

                Somos los Servicios de Apoyo de la Unidad de Investigación del Hospital Nacional de Parapléjicos. Con este blog pretendemos daros a conocer los servicios en detalle. Cada cierto tiempo iremos publicando novedades, estudios que se han hecho, estudios que queremos hacer, respuestas a preguntas que nos hagáis, investigaciones que se han ido publicando en cada una de las técnicas para que podáis conocer más en profundidad lo que podemos ofreceros. La idea es que  cada mes, un  Servicio de Apoyo a la Investigación cuente en detalle alguna técnica.

                La llama del blog será la comunicación bidireccional, el que vosotros os intereséis por alguna técnica o cualquier tipo de información relacionada con el Servicio de la que queráis saber más. Nosotros nos comprometemos a enseñaros y mostraros lo que nuestros equipos y personal son capaces de hacer.

                Nuestra finalidad es darnos a conocer. Así por ejemplo, el 31 de Octubre del 2017 organizamos la primera Jornada de Puertas Abiertas de los Servicios de Apoyo a grupos externos. Fueron las primeras, pero no las últimas.

                Mandaremos un correo  cuando se publique una nueva entrada en el blog para informaros. Crearemos un espacio de preguntas, de comentarios, todo lo que sea para que os entre la curiosidad por saber cada vez más.

“Si no conozco una cosa, la investigaré”. Louis Pasteur